Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RTP1P59025 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RTP1P59025 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RTP1P59025 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RTP1P59025 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RTP1P59025 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTP1P59025 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTP1P59025 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTP1P59025 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTP1P59025 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTP1P59025 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTP1P59025 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTP1P59025 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RTP1P59025 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RTP1P59025 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RTP1P59025 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RTP1P59025 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RTP1P59025 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
RTP1P59025 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTP1P59025 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTP1P59025 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTP1P59025 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTP1P59025 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTP1P59025 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTP1P59025 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTP1P59025 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTP1P59025 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTP1P59025 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTP1P59025 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RTP1P59025 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTP1P59025 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RTP1P59025 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTP1P59025 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RTP1P59025 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTP1P59025 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RTP1P59025 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTP1P59025 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RTP1P59025 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RTP1P59025 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RTP1P59025 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTP1P59025 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTP1P59025 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTP1P59025 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTP1P59025 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTP1P59025 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTP1P59025 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RTP1P59025 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTP1P59025 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTP1P59025 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTP1P59025 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTP1P59025 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTP1P59025 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTP1P59025 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTP1P59025 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTP1P59025 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTP1P59025 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTP1P59025 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RTP1P59025 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTP1P59025 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTP1P59025 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTP1P59025 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RTP1P59025 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RTP1P59025 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RTP1P59025 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTP1P59025 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTP1P59025 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTP1P59025 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTP1P59025 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RTP1P59025 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTP1P59025 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTP1P59025 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTP1P59025 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTP1P59025 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTP1P59025 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTP1P59025 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTP1P59025 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTP1P59025 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTP1P59025 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RTP1P59025 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTP1P59025 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTP1P59025 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTP1P59025 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTP1P59025 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RTP1P59025 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RTP1P59025 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTP1P59025 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTP1P59025 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTP1P59025 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTP1P59025 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTP1P59025 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTP1P59025 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RTP1P59025 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RTP1P59025 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTP1P59025 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RTP1P59025 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTP1P59025 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTP1P59025 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTP1P59025 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTP1P59025 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RTP1P59025 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms