Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
H2BFSP57053 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2BFSP57053 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2BFSP57053 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2BFSP57053 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2BFSP57053 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
H2BFSP57053 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2BFSP57053 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2BFSP57053 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2BFSP57053 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2BFSP57053 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2BFSP57053 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2BFSP57053 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
H2BFSP57053 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2BFSP57053 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2BFSP57053 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2BFSP57053 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2BFSP57053 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2BFSP57053 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2BFSP57053 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2BFSP57053 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2BFSP57053 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
H2BFSP57053 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2BFSP57053 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2BFSP57053 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2BFSP57053 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2BFSP57053 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2BFSP57053 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2BFSP57053 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2BFSP57053 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2BFSP57053 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2BFSP57053 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2BFSP57053 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2BFSP57053 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2BFSP57053 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2BFSP57053 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2BFSP57053 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2BFSP57053 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2BFSP57053 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2BFSP57053 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2BFSP57053 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2BFSP57053 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2BFSP57053 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2BFSP57053 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2BFSP57053 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2BFSP57053 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2BFSP57053 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2BFSP57053 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2BFSP57053 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2BFSP57053 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
H2BFSP57053 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
H2BFSP57053 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2BFSP57053 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2BFSP57053 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
H2BFSP57053 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
H2BFSP57053 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2BFSP57053 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2BFSP57053 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms