Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GFRA1P56159 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GFRA1P56159 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GFRA1P56159 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GFRA1P56159 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GFRA1P56159 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GFRA1P56159 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GFRA1P56159 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GFRA1P56159 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GFRA1P56159 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GFRA1P56159 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GFRA1P56159 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GFRA1P56159 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GFRA1P56159 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFRA1P56159 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFRA1P56159 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GFRA1P56159 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GFRA1P56159 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GFRA1P56159 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GFRA1P56159 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GFRA1P56159 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GFRA1P56159 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GFRA1P56159 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GFRA1P56159 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GFRA1P56159 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GFRA1P56159 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GFRA1P56159 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GFRA1P56159 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GFRA1P56159 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GFRA1P56159 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GFRA1P56159 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GFRA1P56159 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GFRA1P56159 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GFRA1P56159 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GFRA1P56159 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GFRA1P56159 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GFRA1P56159 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GFRA1P56159 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GFRA1P56159 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GFRA1P56159 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GFRA1P56159 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GFRA1P56159 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GFRA1P56159 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GFRA1P56159 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GFRA1P56159 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GFRA1P56159 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GFRA1P56159 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GFRA1P56159 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GFRA1P56159 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GFRA1P56159 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GFRA1P56159 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GFRA1P56159 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GFRA1P56159 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GFRA1P56159 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GFRA1P56159 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GFRA1P56159 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GFRA1P56159 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GFRA1P56159 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GFRA1P56159 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GFRA1P56159 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GFRA1P56159 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GFRA1P56159 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GFRA1P56159 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GFRA1P56159 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GFRA1P56159 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFRA1P56159 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFRA1P56159 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFRA1P56159 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFRA1P56159 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFRA1P56159 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GFRA1P56159 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFRA1P56159 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFRA1P56159 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFRA1P56159 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFRA1P56159 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFRA1P56159 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFRA1P56159 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GFRA1P56159 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFRA1P56159 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFRA1P56159 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFRA1P56159 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFRA1P56159 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFRA1P56159 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GFRA1P56159 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFRA1P56159 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFRA1P56159 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFRA1P56159 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFRA1P56159 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFRA1P56159 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFRA1P56159 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFRA1P56159 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFRA1P56159 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFRA1P56159 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFRA1P56159 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFRA1P56159 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GFRA1P56159 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GFRA1P56159 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFRA1P56159 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFRA1P56159 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFRA1P56159 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms