Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC24CP53992 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC24CP53992 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC24CP53992 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC24CP53992 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC24CP53992 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC24CP53992 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC24CP53992 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC24CP53992 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC24CP53992 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC24CP53992 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC24CP53992 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC24CP53992 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC24CP53992 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC24CP53992 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC24CP53992 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC24CP53992 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC24CP53992 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC24CP53992 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC24CP53992 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC24CP53992 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC24CP53992 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC24CP53992 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC24CP53992 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC24CP53992 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC24CP53992 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC24CP53992 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC24CP53992 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC24CP53992 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC24CP53992 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC24CP53992 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC24CP53992 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEC24CP53992 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEC24CP53992 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEC24CP53992 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEC24CP53992 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC24CP53992 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC24CP53992 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC24CP53992 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC24CP53992 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC24CP53992 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC24CP53992 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC24CP53992 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC24CP53992 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC24CP53992 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms