Protein–RNA interactions for Protein: P53985

SLC16A1, Monocarboxylate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A1P53985 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC16A1P53985 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC16A1P53985 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC16A1P53985 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC16A1P53985 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC16A1P53985 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC16A1P53985 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC16A1P53985 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC16A1P53985 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC16A1P53985 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC16A1P53985 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC16A1P53985 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC16A1P53985 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC16A1P53985 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC16A1P53985 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC16A1P53985 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC16A1P53985 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC16A1P53985 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC16A1P53985 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC16A1P53985 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC16A1P53985 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC16A1P53985 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC16A1P53985 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC16A1P53985 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC16A1P53985 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC16A1P53985 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC16A1P53985 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC16A1P53985 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC16A1P53985 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC16A1P53985 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC16A1P53985 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC16A1P53985 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC16A1P53985 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC16A1P53985 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC16A1P53985 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC16A1P53985 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC16A1P53985 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC16A1P53985 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC16A1P53985 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC16A1P53985 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC16A1P53985 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC16A1P53985 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC16A1P53985 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC16A1P53985 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC16A1P53985 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC16A1P53985 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC16A1P53985 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC16A1P53985 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC16A1P53985 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC16A1P53985 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC16A1P53985 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC16A1P53985 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC16A1P53985 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC16A1P53985 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC16A1P53985 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC16A1P53985 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC16A1P53985 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC16A1P53985 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC16A1P53985 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms