Protein–RNA interactions for Protein: P53673

CRYBA4, Beta-crystallin A4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA4P53673 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRYBA4P53673 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRYBA4P53673 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRYBA4P53673 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CRYBA4P53673 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.8 ms