Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBE2E1P51965 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2E1P51965 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2E1P51965 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2E1P51965 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2E1P51965 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2E1P51965 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2E1P51965 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2E1P51965 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2E1P51965 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2E1P51965 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2E1P51965 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2E1P51965 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2E1P51965 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2E1P51965 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE2E1P51965 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE2E1P51965 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE2E1P51965 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE2E1P51965 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE2E1P51965 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE2E1P51965 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE2E1P51965 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE2E1P51965 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE2E1P51965 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE2E1P51965 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE2E1P51965 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE2E1P51965 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE2E1P51965 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE2E1P51965 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE2E1P51965 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE2E1P51965 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE2E1P51965 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE2E1P51965 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE2E1P51965 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE2E1P51965 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE2E1P51965 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE2E1P51965 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBE2E1P51965 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE2E1P51965 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE2E1P51965 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE2E1P51965 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE2E1P51965 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UBE2E1P51965 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBE2E1P51965 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UBE2E1P51965 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBE2E1P51965 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBE2E1P51965 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBE2E1P51965 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBE2E1P51965 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE2E1P51965 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE2E1P51965 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE2E1P51965 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE2E1P51965 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE2E1P51965 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE2E1P51965 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE2E1P51965 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE2E1P51965 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE2E1P51965 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms