Protein–RNA interactions for Protein: P51826

AFF3, AF4/FMR2 family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF3P51826 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFF3P51826 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFF3P51826 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFF3P51826 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFF3P51826 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
AFF3P51826 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFF3P51826 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFF3P51826 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFF3P51826 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFF3P51826 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
AFF3P51826 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFF3P51826 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
AFF3P51826 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
AFF3P51826 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFF3P51826 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFF3P51826 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFF3P51826 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFF3P51826 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFF3P51826 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFF3P51826 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFF3P51826 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
AFF3P51826 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFF3P51826 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFF3P51826 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFF3P51826 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFF3P51826 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
AFF3P51826 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFF3P51826 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFF3P51826 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AFF3P51826 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AFF3P51826 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AFF3P51826 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AFF3P51826 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AFF3P51826 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AFF3P51826 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AFF3P51826 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AFF3P51826 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AFF3P51826 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
AFF3P51826 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AFF3P51826 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AFF3P51826 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AFF3P51826 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AFF3P51826 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AFF3P51826 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AFF3P51826 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AFF3P51826 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AFF3P51826 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AFF3P51826 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AFF3P51826 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AFF3P51826 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFF3P51826 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFF3P51826 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFF3P51826 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFF3P51826 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
AFF3P51826 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFF3P51826 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFF3P51826 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFF3P51826 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFF3P51826 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFF3P51826 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFF3P51826 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFF3P51826 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFF3P51826 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFF3P51826 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFF3P51826 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFF3P51826 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFF3P51826 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFF3P51826 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFF3P51826 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFF3P51826 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFF3P51826 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
AFF3P51826 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AFF3P51826 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AFF3P51826 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AFF3P51826 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AFF3P51826 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFF3P51826 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFF3P51826 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFF3P51826 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFF3P51826 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFF3P51826 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFF3P51826 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFF3P51826 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFF3P51826 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AFF3P51826 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AFF3P51826 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AFF3P51826 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AFF3P51826 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AFF3P51826 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AFF3P51826 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
AFF3P51826 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
AFF3P51826 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AFF3P51826 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AFF3P51826 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AFF3P51826 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AFF3P51826 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AFF3P51826 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AFF3P51826 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AFF3P51826 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
AFF3P51826 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms