Protein–RNA interactions for Protein: P49223

SPINT3, Kunitz-type protease inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT3P49223 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPINT3P49223 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SPINT3P49223 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPINT3P49223 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SPINT3P49223 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPINT3P49223 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPINT3P49223 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPINT3P49223 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPINT3P49223 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPINT3P49223 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPINT3P49223 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPINT3P49223 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPINT3P49223 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPINT3P49223 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SPINT3P49223 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPINT3P49223 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPINT3P49223 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPINT3P49223 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPINT3P49223 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPINT3P49223 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPINT3P49223 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPINT3P49223 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPINT3P49223 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPINT3P49223 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPINT3P49223 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPINT3P49223 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPINT3P49223 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SPINT3P49223 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPINT3P49223 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPINT3P49223 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPINT3P49223 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPINT3P49223 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPINT3P49223 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPINT3P49223 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPINT3P49223 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPINT3P49223 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SPINT3P49223 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPINT3P49223 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPINT3P49223 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPINT3P49223 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPINT3P49223 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPINT3P49223 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPINT3P49223 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPINT3P49223 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPINT3P49223 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPINT3P49223 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPINT3P49223 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPINT3P49223 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPINT3P49223 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPINT3P49223 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SPINT3P49223 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPINT3P49223 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPINT3P49223 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPINT3P49223 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPINT3P49223 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPINT3P49223 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPINT3P49223 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SPINT3P49223 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPINT3P49223 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPINT3P49223 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPINT3P49223 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPINT3P49223 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPINT3P49223 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPINT3P49223 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPINT3P49223 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPINT3P49223 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPINT3P49223 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPINT3P49223 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPINT3P49223 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPINT3P49223 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPINT3P49223 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPINT3P49223 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SPINT3P49223 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPINT3P49223 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPINT3P49223 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPINT3P49223 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SPINT3P49223 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPINT3P49223 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPINT3P49223 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPINT3P49223 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPINT3P49223 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPINT3P49223 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPINT3P49223 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPINT3P49223 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPINT3P49223 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPINT3P49223 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPINT3P49223 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPINT3P49223 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPINT3P49223 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPINT3P49223 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPINT3P49223 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPINT3P49223 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPINT3P49223 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPINT3P49223 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPINT3P49223 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPINT3P49223 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPINT3P49223 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPINT3P49223 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPINT3P49223 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPINT3P49223 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms