Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ETV4P43268 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ETV4P43268 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ETV4P43268 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ETV4P43268 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ETV4P43268 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ETV4P43268 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ETV4P43268 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ETV4P43268 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ETV4P43268 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ETV4P43268 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ETV4P43268 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ETV4P43268 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ETV4P43268 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ETV4P43268 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ETV4P43268 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ETV4P43268 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ETV4P43268 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ETV4P43268 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ETV4P43268 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ETV4P43268 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ETV4P43268 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ETV4P43268 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ETV4P43268 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ETV4P43268 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ETV4P43268 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ETV4P43268 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ETV4P43268 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ETV4P43268 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ETV4P43268 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ETV4P43268 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ETV4P43268 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ETV4P43268 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ETV4P43268 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ETV4P43268 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ETV4P43268 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ETV4P43268 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ETV4P43268 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ETV4P43268 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ETV4P43268 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ETV4P43268 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ETV4P43268 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ETV4P43268 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ETV4P43268 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ETV4P43268 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ETV4P43268 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ETV4P43268 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ETV4P43268 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ETV4P43268 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ETV4P43268 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ETV4P43268 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ETV4P43268 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ETV4P43268 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ETV4P43268 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ETV4P43268 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ETV4P43268 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ETV4P43268 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ETV4P43268 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ETV4P43268 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ETV4P43268 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ETV4P43268 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ETV4P43268 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ETV4P43268 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ETV4P43268 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ETV4P43268 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ETV4P43268 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ETV4P43268 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ETV4P43268 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ETV4P43268 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ETV4P43268 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ETV4P43268 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ETV4P43268 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ETV4P43268 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ETV4P43268 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ETV4P43268 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ETV4P43268 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ETV4P43268 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ETV4P43268 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ETV4P43268 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ETV4P43268 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ETV4P43268 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ETV4P43268 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ETV4P43268 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ETV4P43268 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ETV4P43268 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ETV4P43268 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ETV4P43268 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ETV4P43268 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ETV4P43268 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ETV4P43268 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ETV4P43268 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ETV4P43268 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ETV4P43268 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ETV4P43268 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ETV4P43268 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ETV4P43268 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ETV4P43268 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ETV4P43268 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ETV4P43268 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ETV4P43268 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms