Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARL1P40616 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARL1P40616 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARL1P40616 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARL1P40616 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARL1P40616 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARL1P40616 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARL1P40616 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARL1P40616 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARL1P40616 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARL1P40616 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARL1P40616 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARL1P40616 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARL1P40616 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ARL1P40616 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARL1P40616 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARL1P40616 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ARL1P40616 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARL1P40616 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARL1P40616 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARL1P40616 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARL1P40616 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARL1P40616 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARL1P40616 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARL1P40616 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARL1P40616 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARL1P40616 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARL1P40616 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARL1P40616 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARL1P40616 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ARL1P40616 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARL1P40616 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARL1P40616 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARL1P40616 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARL1P40616 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARL1P40616 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARL1P40616 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARL1P40616 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARL1P40616 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARL1P40616 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARL1P40616 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARL1P40616 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARL1P40616 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARL1P40616 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARL1P40616 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARL1P40616 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARL1P40616 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARL1P40616 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARL1P40616 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARL1P40616 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARL1P40616 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARL1P40616 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARL1P40616 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARL1P40616 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARL1P40616 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARL1P40616 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARL1P40616 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARL1P40616 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARL1P40616 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARL1P40616 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ARL1P40616 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARL1P40616 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARL1P40616 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARL1P40616 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARL1P40616 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARL1P40616 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARL1P40616 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARL1P40616 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARL1P40616 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARL1P40616 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARL1P40616 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARL1P40616 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARL1P40616 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARL1P40616 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ARL1P40616 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ARL1P40616 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ARL1P40616 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ARL1P40616 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ARL1P40616 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ARL1P40616 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ARL1P40616 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ARL1P40616 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ARL1P40616 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARL1P40616 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARL1P40616 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARL1P40616 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARL1P40616 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARL1P40616 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ARL1P40616 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ARL1P40616 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ARL1P40616 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARL1P40616 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARL1P40616 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ARL1P40616 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARL1P40616 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
ARL1P40616 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARL1P40616 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARL1P40616 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARL1P40616 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARL1P40616 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms