Protein–RNA interactions for Protein: P35613

BSG, Basigin, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSGP35613 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BSGP35613 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BSGP35613 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BSGP35613 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BSGP35613 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BSGP35613 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BSGP35613 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BSGP35613 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BSGP35613 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BSGP35613 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BSGP35613 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BSGP35613 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BSGP35613 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BSGP35613 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BSGP35613 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BSGP35613 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BSGP35613 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BSGP35613 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BSGP35613 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BSGP35613 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BSGP35613 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BSGP35613 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BSGP35613 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BSGP35613 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BSGP35613 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BSGP35613 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BSGP35613 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BSGP35613 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BSGP35613 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BSGP35613 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BSGP35613 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BSGP35613 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BSGP35613 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BSGP35613 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BSGP35613 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BSGP35613 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BSGP35613 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BSGP35613 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BSGP35613 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BSGP35613 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BSGP35613 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BSGP35613 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BSGP35613 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BSGP35613 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BSGP35613 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BSGP35613 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BSGP35613 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BSGP35613 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BSGP35613 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BSGP35613 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BSGP35613 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BSGP35613 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BSGP35613 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BSGP35613 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BSGP35613 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BSGP35613 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BSGP35613 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BSGP35613 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BSGP35613 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BSGP35613 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BSGP35613 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BSGP35613 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BSGP35613 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BSGP35613 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BSGP35613 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BSGP35613 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BSGP35613 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BSGP35613 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BSGP35613 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BSGP35613 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BSGP35613 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BSGP35613 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BSGP35613 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BSGP35613 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BSGP35613 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BSGP35613 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BSGP35613 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BSGP35613 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BSGP35613 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BSGP35613 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BSGP35613 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BSGP35613 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BSGP35613 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BSGP35613 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BSGP35613 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BSGP35613 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BSGP35613 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BSGP35613 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BSGP35613 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BSGP35613 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BSGP35613 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BSGP35613 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BSGP35613 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BSGP35613 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BSGP35613 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BSGP35613 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BSGP35613 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BSGP35613 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BSGP35613 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BSGP35613 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms