Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD12P35452 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD12P35452 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD12P35452 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD12P35452 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD12P35452 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD12P35452 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD12P35452 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD12P35452 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD12P35452 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD12P35452 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD12P35452 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD12P35452 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD12P35452 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD12P35452 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD12P35452 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD12P35452 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD12P35452 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD12P35452 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD12P35452 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD12P35452 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD12P35452 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD12P35452 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD12P35452 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD12P35452 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD12P35452 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD12P35452 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD12P35452 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD12P35452 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD12P35452 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD12P35452 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD12P35452 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD12P35452 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD12P35452 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD12P35452 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD12P35452 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD12P35452 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD12P35452 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD12P35452 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD12P35452 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD12P35452 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD12P35452 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD12P35452 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD12P35452 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD12P35452 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD12P35452 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD12P35452 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD12P35452 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXD12P35452 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXD12P35452 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXD12P35452 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXD12P35452 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXD12P35452 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXD12P35452 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXD12P35452 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD12P35452 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD12P35452 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD12P35452 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD12P35452 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXD12P35452 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXD12P35452 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXD12P35452 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXD12P35452 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXD12P35452 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXD12P35452 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXD12P35452 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXD12P35452 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXD12P35452 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXD12P35452 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXD12P35452 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXD12P35452 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD12P35452 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD12P35452 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD12P35452 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD12P35452 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD12P35452 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXD12P35452 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXD12P35452 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXD12P35452 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXD12P35452 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD12P35452 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD12P35452 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD12P35452 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD12P35452 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD12P35452 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD12P35452 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD12P35452 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD12P35452 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD12P35452 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD12P35452 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD12P35452 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD12P35452 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD12P35452 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD12P35452 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD12P35452 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD12P35452 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD12P35452 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD12P35452 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD12P35452 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD12P35452 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms