Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXD11P31277 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXD11P31277 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXD11P31277 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXD11P31277 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXD11P31277 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXD11P31277 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXD11P31277 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXD11P31277 METTL23-207ENST00000588783 1184 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXD11P31277 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXD11P31277 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXD11P31277 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXD11P31277 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXD11P31277 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXD11P31277 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXD11P31277 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXD11P31277 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXD11P31277 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXD11P31277 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXD11P31277 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXD11P31277 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXD11P31277 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXD11P31277 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXD11P31277 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXD11P31277 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXD11P31277 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXD11P31277 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXD11P31277 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOXD11P31277 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXD11P31277 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXD11P31277 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXD11P31277 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXD11P31277 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXD11P31277 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXD11P31277 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXD11P31277 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXD11P31277 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXD11P31277 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXD11P31277 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXD11P31277 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXD11P31277 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXD11P31277 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXD11P31277 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXD11P31277 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD11P31277 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD11P31277 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD11P31277 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD11P31277 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD11P31277 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD11P31277 AC022148.2-201ENST00000586176 560 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD11P31277 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD11P31277 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD11P31277 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD11P31277 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD11P31277 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD11P31277 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD11P31277 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXD11P31277 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXD11P31277 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXD11P31277 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXD11P31277 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXD11P31277 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXD11P31277 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXD11P31277 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXD11P31277 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXD11P31277 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXD11P31277 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXD11P31277 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXD11P31277 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXD11P31277 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXD11P31277 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXD11P31277 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXD11P31277 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXD11P31277 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXD11P31277 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD11P31277 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD11P31277 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD11P31277 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD11P31277 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD11P31277 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD11P31277 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD11P31277 ITGB5-AS1-201ENST00000495917 460 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD11P31277 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD11P31277 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD11P31277 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD11P31277 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD11P31277 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXD11P31277 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXD11P31277 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXD11P31277 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD11P31277 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD11P31277 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD11P31277 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD11P31277 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD11P31277 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD11P31277 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD11P31277 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD11P31277 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD11P31277 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXD11P31277 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms