Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP5A1P25705 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP5A1P25705 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP5A1P25705 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP5A1P25705 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP5A1P25705 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP5A1P25705 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP5A1P25705 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP5A1P25705 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP5A1P25705 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP5A1P25705 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP5A1P25705 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP5A1P25705 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP5A1P25705 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP5A1P25705 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP5A1P25705 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP5A1P25705 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP5A1P25705 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP5A1P25705 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP5A1P25705 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP5A1P25705 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP5A1P25705 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP5A1P25705 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP5A1P25705 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP5A1P25705 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP5A1P25705 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP5A1P25705 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP5A1P25705 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP5A1P25705 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP5A1P25705 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP5A1P25705 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP5A1P25705 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP5A1P25705 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP5A1P25705 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP5A1P25705 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP5A1P25705 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP5A1P25705 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP5A1P25705 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP5A1P25705 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP5A1P25705 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP5A1P25705 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP5A1P25705 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP5A1P25705 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP5A1P25705 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP5A1P25705 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP5A1P25705 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP5A1P25705 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP5A1P25705 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP5A1P25705 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP5A1P25705 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP5A1P25705 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP5A1P25705 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP5A1P25705 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP5A1P25705 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP5A1P25705 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP5A1P25705 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP5A1P25705 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP5A1P25705 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP5A1P25705 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP5A1P25705 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP5A1P25705 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP5A1P25705 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP5A1P25705 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP5A1P25705 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP5A1P25705 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP5A1P25705 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP5A1P25705 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP5A1P25705 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP5A1P25705 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP5A1P25705 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP5A1P25705 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP5A1P25705 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP5A1P25705 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP5A1P25705 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP5A1P25705 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP5A1P25705 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP5A1P25705 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP5A1P25705 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP5A1P25705 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP5A1P25705 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP5A1P25705 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP5A1P25705 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP5A1P25705 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP5A1P25705 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5A1P25705 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5A1P25705 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP5A1P25705 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP5A1P25705 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP5A1P25705 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP5A1P25705 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP5A1P25705 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP5A1P25705 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP5A1P25705 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP5A1P25705 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP5A1P25705 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP5A1P25705 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP5A1P25705 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP5A1P25705 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP5A1P25705 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP5A1P25705 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms