Protein–RNA interactions for Protein: P22362

CCL1, C-C motif chemokine 1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL1P22362 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL1P22362 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL1P22362 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL1P22362 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL1P22362 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL1P22362 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL1P22362 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL1P22362 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL1P22362 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL1P22362 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCL1P22362 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCL1P22362 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL1P22362 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL1P22362 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCL1P22362 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL1P22362 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCL1P22362 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL1P22362 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL1P22362 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCL1P22362 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL1P22362 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCL1P22362 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCL1P22362 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL1P22362 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL1P22362 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL1P22362 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL1P22362 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL1P22362 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL1P22362 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCL1P22362 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCL1P22362 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL1P22362 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL1P22362 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL1P22362 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL1P22362 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL1P22362 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCL1P22362 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCL1P22362 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCL1P22362 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCL1P22362 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL1P22362 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL1P22362 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL1P22362 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL1P22362 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL1P22362 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCL1P22362 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCL1P22362 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCL1P22362 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCL1P22362 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCL1P22362 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CCL1P22362 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCL1P22362 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCL1P22362 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCL1P22362 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCL1P22362 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCL1P22362 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCL1P22362 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCL1P22362 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCL1P22362 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCL1P22362 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCL1P22362 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCL1P22362 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCL1P22362 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCL1P22362 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCL1P22362 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCL1P22362 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCL1P22362 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCL1P22362 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCL1P22362 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCL1P22362 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCL1P22362 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCL1P22362 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCL1P22362 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCL1P22362 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCL1P22362 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCL1P22362 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCL1P22362 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCL1P22362 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCL1P22362 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCL1P22362 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCL1P22362 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCL1P22362 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCL1P22362 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCL1P22362 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCL1P22362 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCL1P22362 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCL1P22362 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCL1P22362 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCL1P22362 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCL1P22362 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCL1P22362 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCL1P22362 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCL1P22362 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCL1P22362 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCL1P22362 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCL1P22362 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCL1P22362 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCL1P22362 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCL1P22362 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCL1P22362 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms