Protein–RNA interactions for Protein: P22090

RPS4Y1, 40S ribosomal protein S4, Y isoform 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4Y1P22090 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RPS4Y1P22090 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS4Y1P22090 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS4Y1P22090 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS4Y1P22090 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS4Y1P22090 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS4Y1P22090 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS4Y1P22090 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS4Y1P22090 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS4Y1P22090 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS4Y1P22090 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS4Y1P22090 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS4Y1P22090 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS4Y1P22090 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS4Y1P22090 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS4Y1P22090 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS4Y1P22090 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS4Y1P22090 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS4Y1P22090 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS4Y1P22090 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS4Y1P22090 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS4Y1P22090 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS4Y1P22090 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS4Y1P22090 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS4Y1P22090 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS4Y1P22090 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS4Y1P22090 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS4Y1P22090 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS4Y1P22090 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS4Y1P22090 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS4Y1P22090 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS4Y1P22090 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS4Y1P22090 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS4Y1P22090 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS4Y1P22090 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS4Y1P22090 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS4Y1P22090 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS4Y1P22090 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS4Y1P22090 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS4Y1P22090 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS4Y1P22090 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS4Y1P22090 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS4Y1P22090 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS4Y1P22090 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS4Y1P22090 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS4Y1P22090 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS4Y1P22090 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS4Y1P22090 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS4Y1P22090 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS4Y1P22090 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS4Y1P22090 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS4Y1P22090 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS4Y1P22090 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS4Y1P22090 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS4Y1P22090 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS4Y1P22090 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS4Y1P22090 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS4Y1P22090 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS4Y1P22090 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS4Y1P22090 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS4Y1P22090 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS4Y1P22090 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS4Y1P22090 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS4Y1P22090 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS4Y1P22090 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS4Y1P22090 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS4Y1P22090 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS4Y1P22090 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS4Y1P22090 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS4Y1P22090 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS4Y1P22090 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS4Y1P22090 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms