Protein–RNA interactions for Protein: P19388

POLR2E, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2EP19388 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2EP19388 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2EP19388 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2EP19388 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2EP19388 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2EP19388 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2EP19388 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2EP19388 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2EP19388 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2EP19388 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2EP19388 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2EP19388 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR2EP19388 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR2EP19388 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR2EP19388 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2EP19388 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2EP19388 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2EP19388 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2EP19388 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2EP19388 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2EP19388 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2EP19388 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2EP19388 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2EP19388 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2EP19388 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2EP19388 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2EP19388 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2EP19388 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2EP19388 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2EP19388 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2EP19388 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2EP19388 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2EP19388 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2EP19388 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2EP19388 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2EP19388 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2EP19388 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2EP19388 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2EP19388 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2EP19388 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2EP19388 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2EP19388 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2EP19388 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2EP19388 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2EP19388 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2EP19388 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
POLR2EP19388 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2EP19388 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR2EP19388 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2EP19388 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2EP19388 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2EP19388 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2EP19388 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2EP19388 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2EP19388 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2EP19388 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2EP19388 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2EP19388 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms