Protein–RNA interactions for Protein: P18848

ATF4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF4P18848 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATF4P18848 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATF4P18848 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATF4P18848 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATF4P18848 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATF4P18848 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATF4P18848 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATF4P18848 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATF4P18848 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATF4P18848 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATF4P18848 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATF4P18848 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATF4P18848 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATF4P18848 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATF4P18848 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATF4P18848 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATF4P18848 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATF4P18848 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATF4P18848 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATF4P18848 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATF4P18848 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATF4P18848 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATF4P18848 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATF4P18848 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATF4P18848 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATF4P18848 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATF4P18848 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ATF4P18848 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATF4P18848 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATF4P18848 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATF4P18848 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATF4P18848 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATF4P18848 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATF4P18848 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATF4P18848 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATF4P18848 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATF4P18848 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATF4P18848 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATF4P18848 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATF4P18848 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATF4P18848 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATF4P18848 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATF4P18848 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATF4P18848 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATF4P18848 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATF4P18848 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATF4P18848 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATF4P18848 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATF4P18848 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATF4P18848 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATF4P18848 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATF4P18848 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATF4P18848 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATF4P18848 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATF4P18848 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATF4P18848 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATF4P18848 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ATF4P18848 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATF4P18848 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATF4P18848 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATF4P18848 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATF4P18848 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATF4P18848 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATF4P18848 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATF4P18848 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATF4P18848 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATF4P18848 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATF4P18848 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATF4P18848 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATF4P18848 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATF4P18848 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATF4P18848 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATF4P18848 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATF4P18848 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATF4P18848 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATF4P18848 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATF4P18848 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATF4P18848 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATF4P18848 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATF4P18848 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATF4P18848 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATF4P18848 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATF4P18848 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATF4P18848 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATF4P18848 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATF4P18848 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATF4P18848 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATF4P18848 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATF4P18848 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATF4P18848 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATF4P18848 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATF4P18848 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATF4P18848 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATF4P18848 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATF4P18848 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATF4P18848 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATF4P18848 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATF4P18848 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ATF4P18848 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATF4P18848 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 328.6 ms