Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLUP10909 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLUP10909 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLUP10909 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLUP10909 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLUP10909 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLUP10909 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLUP10909 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLUP10909 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLUP10909 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLUP10909 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLUP10909 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLUP10909 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLUP10909 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLUP10909 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLUP10909 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLUP10909 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLUP10909 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLUP10909 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLUP10909 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLUP10909 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLUP10909 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLUP10909 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLUP10909 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLUP10909 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLUP10909 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLUP10909 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLUP10909 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLUP10909 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLUP10909 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLUP10909 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLUP10909 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLUP10909 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLUP10909 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLUP10909 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLUP10909 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLUP10909 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLUP10909 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLUP10909 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLUP10909 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLUP10909 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CLUP10909 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLUP10909 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLUP10909 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLUP10909 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLUP10909 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLUP10909 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLUP10909 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLUP10909 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLUP10909 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLUP10909 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLUP10909 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLUP10909 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLUP10909 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLUP10909 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLUP10909 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLUP10909 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLUP10909 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLUP10909 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLUP10909 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLUP10909 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLUP10909 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLUP10909 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLUP10909 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLUP10909 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLUP10909 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLUP10909 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLUP10909 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLUP10909 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLUP10909 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLUP10909 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLUP10909 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLUP10909 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLUP10909 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLUP10909 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLUP10909 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLUP10909 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLUP10909 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLUP10909 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLUP10909 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLUP10909 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLUP10909 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLUP10909 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLUP10909 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLUP10909 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLUP10909 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLUP10909 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLUP10909 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLUP10909 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLUP10909 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLUP10909 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLUP10909 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLUP10909 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLUP10909 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLUP10909 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLUP10909 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLUP10909 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLUP10909 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLUP10909 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLUP10909 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms