Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF888P0CJ79 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF888P0CJ79 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF888P0CJ79 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF888P0CJ79 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF888P0CJ79 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF888P0CJ79 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF888P0CJ79 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF888P0CJ79 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF888P0CJ79 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF888P0CJ79 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF888P0CJ79 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF888P0CJ79 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF888P0CJ79 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF888P0CJ79 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF888P0CJ79 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF888P0CJ79 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF888P0CJ79 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF888P0CJ79 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF888P0CJ79 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF888P0CJ79 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF888P0CJ79 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF888P0CJ79 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF888P0CJ79 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF888P0CJ79 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF888P0CJ79 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF888P0CJ79 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF888P0CJ79 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF888P0CJ79 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF888P0CJ79 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF888P0CJ79 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF888P0CJ79 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF888P0CJ79 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF888P0CJ79 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF888P0CJ79 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF888P0CJ79 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF888P0CJ79 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF888P0CJ79 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF888P0CJ79 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF888P0CJ79 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF888P0CJ79 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF888P0CJ79 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
ZNF888P0CJ79 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF888P0CJ79 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF888P0CJ79 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF888P0CJ79 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF888P0CJ79 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF888P0CJ79 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF888P0CJ79 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF888P0CJ79 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF888P0CJ79 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF888P0CJ79 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF888P0CJ79 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF888P0CJ79 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF888P0CJ79 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF888P0CJ79 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF888P0CJ79 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF888P0CJ79 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF888P0CJ79 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF888P0CJ79 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF888P0CJ79 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF888P0CJ79 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF888P0CJ79 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF888P0CJ79 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF888P0CJ79 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF888P0CJ79 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF888P0CJ79 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF888P0CJ79 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF888P0CJ79 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF888P0CJ79 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF888P0CJ79 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF888P0CJ79 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF888P0CJ79 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF888P0CJ79 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF888P0CJ79 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF888P0CJ79 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF888P0CJ79 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF888P0CJ79 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF888P0CJ79 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF888P0CJ79 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF888P0CJ79 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF888P0CJ79 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF888P0CJ79 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF888P0CJ79 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF888P0CJ79 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF888P0CJ79 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF888P0CJ79 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF888P0CJ79 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF888P0CJ79 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF888P0CJ79 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF888P0CJ79 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF888P0CJ79 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF888P0CJ79 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF888P0CJ79 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF888P0CJ79 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF888P0CJ79 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF888P0CJ79 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF888P0CJ79 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF888P0CJ79 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF888P0CJ79 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms