Protein–RNA interactions for Protein: P0CB38

PABPC4L, Polyadenylate-binding protein 4-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4LP0CB38 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC4LP0CB38 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC4LP0CB38 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC4LP0CB38 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC4LP0CB38 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC4LP0CB38 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC4LP0CB38 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC4LP0CB38 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC4LP0CB38 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC4LP0CB38 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC4LP0CB38 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPC4LP0CB38 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPC4LP0CB38 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC4LP0CB38 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC4LP0CB38 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC4LP0CB38 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC4LP0CB38 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC4LP0CB38 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC4LP0CB38 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC4LP0CB38 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC4LP0CB38 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC4LP0CB38 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC4LP0CB38 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC4LP0CB38 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC4LP0CB38 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC4LP0CB38 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC4LP0CB38 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC4LP0CB38 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PABPC4LP0CB38 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC4LP0CB38 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC4LP0CB38 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC4LP0CB38 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC4LP0CB38 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC4LP0CB38 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC4LP0CB38 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC4LP0CB38 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC4LP0CB38 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC4LP0CB38 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC4LP0CB38 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC4LP0CB38 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC4LP0CB38 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC4LP0CB38 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC4LP0CB38 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC4LP0CB38 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC4LP0CB38 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC4LP0CB38 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC4LP0CB38 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC4LP0CB38 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC4LP0CB38 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC4LP0CB38 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC4LP0CB38 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC4LP0CB38 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPC4LP0CB38 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPC4LP0CB38 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPC4LP0CB38 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPC4LP0CB38 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPC4LP0CB38 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PABPC4LP0CB38 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PABPC4LP0CB38 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PABPC4LP0CB38 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PABPC4LP0CB38 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PABPC4LP0CB38 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PABPC4LP0CB38 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PABPC4LP0CB38 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PABPC4LP0CB38 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PABPC4LP0CB38 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PABPC4LP0CB38 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PABPC4LP0CB38 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PABPC4LP0CB38 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PABPC4LP0CB38 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PABPC4LP0CB38 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PABPC4LP0CB38 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PABPC4LP0CB38 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PABPC4LP0CB38 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PABPC4LP0CB38 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PABPC4LP0CB38 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PABPC4LP0CB38 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PABPC4LP0CB38 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PABPC4LP0CB38 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PABPC4LP0CB38 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PABPC4LP0CB38 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PABPC4LP0CB38 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PABPC4LP0CB38 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PABPC4LP0CB38 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PABPC4LP0CB38 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PABPC4LP0CB38 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PABPC4LP0CB38 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PABPC4LP0CB38 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PABPC4LP0CB38 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PABPC4LP0CB38 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PABPC4LP0CB38 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PABPC4LP0CB38 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PABPC4LP0CB38 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PABPC4LP0CB38 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PABPC4LP0CB38 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PABPC4LP0CB38 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PABPC4LP0CB38 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PABPC4LP0CB38 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PABPC4LP0CB38 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PABPC4LP0CB38 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms