Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LINC00271P0C7V0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LINC00271P0C7V0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LINC00271P0C7V0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LINC00271P0C7V0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LINC00271P0C7V0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LINC00271P0C7V0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LINC00271P0C7V0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LINC00271P0C7V0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LINC00271P0C7V0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LINC00271P0C7V0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LINC00271P0C7V0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LINC00271P0C7V0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LINC00271P0C7V0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LINC00271P0C7V0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LINC00271P0C7V0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LINC00271P0C7V0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LINC00271P0C7V0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LINC00271P0C7V0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LINC00271P0C7V0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LINC00271P0C7V0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LINC00271P0C7V0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LINC00271P0C7V0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LINC00271P0C7V0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LINC00271P0C7V0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LINC00271P0C7V0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LINC00271P0C7V0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LINC00271P0C7V0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LINC00271P0C7V0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LINC00271P0C7V0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LINC00271P0C7V0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LINC00271P0C7V0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LINC00271P0C7V0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LINC00271P0C7V0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LINC00271P0C7V0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LINC00271P0C7V0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LINC00271P0C7V0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LINC00271P0C7V0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LINC00271P0C7V0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LINC00271P0C7V0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LINC00271P0C7V0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LINC00271P0C7V0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LINC00271P0C7V0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LINC00271P0C7V0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LINC00271P0C7V0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LINC00271P0C7V0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LINC00271P0C7V0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LINC00271P0C7V0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINC00271P0C7V0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINC00271P0C7V0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINC00271P0C7V0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LINC00271P0C7V0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINC00271P0C7V0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINC00271P0C7V0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINC00271P0C7V0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LINC00271P0C7V0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINC00271P0C7V0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LINC00271P0C7V0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LINC00271P0C7V0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LINC00271P0C7V0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LINC00271P0C7V0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LINC00271P0C7V0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LINC00271P0C7V0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LINC00271P0C7V0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LINC00271P0C7V0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LINC00271P0C7V0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LINC00271P0C7V0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LINC00271P0C7V0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LINC00271P0C7V0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LINC00271P0C7V0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LINC00271P0C7V0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LINC00271P0C7V0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LINC00271P0C7V0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LINC00271P0C7V0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LINC00271P0C7V0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LINC00271P0C7V0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LINC00271P0C7V0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LINC00271P0C7V0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LINC00271P0C7V0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LINC00271P0C7V0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LINC00271P0C7V0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LINC00271P0C7V0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LINC00271P0C7V0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LINC00271P0C7V0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LINC00271P0C7V0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LINC00271P0C7V0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LINC00271P0C7V0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LINC00271P0C7V0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LINC00271P0C7V0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LINC00271P0C7V0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LINC00271P0C7V0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LINC00271P0C7V0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LINC00271P0C7V0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LINC00271P0C7V0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LINC00271P0C7V0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LINC00271P0C7V0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LINC00271P0C7V0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LINC00271P0C7V0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LINC00271P0C7V0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LINC00271P0C7V0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms