Protein–RNA interactions for Protein: P0C0E4

RAB40AL, Ras-related protein Rab-40A-like, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40ALP0C0E4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB40ALP0C0E4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB40ALP0C0E4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB40ALP0C0E4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB40ALP0C0E4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB40ALP0C0E4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB40ALP0C0E4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB40ALP0C0E4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB40ALP0C0E4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB40ALP0C0E4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB40ALP0C0E4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB40ALP0C0E4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB40ALP0C0E4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB40ALP0C0E4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB40ALP0C0E4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB40ALP0C0E4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB40ALP0C0E4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB40ALP0C0E4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB40ALP0C0E4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB40ALP0C0E4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB40ALP0C0E4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB40ALP0C0E4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB40ALP0C0E4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB40ALP0C0E4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB40ALP0C0E4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB40ALP0C0E4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB40ALP0C0E4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB40ALP0C0E4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB40ALP0C0E4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB40ALP0C0E4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB40ALP0C0E4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB40ALP0C0E4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB40ALP0C0E4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB40ALP0C0E4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB40ALP0C0E4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB40ALP0C0E4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB40ALP0C0E4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB40ALP0C0E4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB40ALP0C0E4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB40ALP0C0E4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB40ALP0C0E4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB40ALP0C0E4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB40ALP0C0E4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB40ALP0C0E4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB40ALP0C0E4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB40ALP0C0E4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB40ALP0C0E4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB40ALP0C0E4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB40ALP0C0E4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB40ALP0C0E4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB40ALP0C0E4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB40ALP0C0E4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB40ALP0C0E4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB40ALP0C0E4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB40ALP0C0E4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB40ALP0C0E4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB40ALP0C0E4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB40ALP0C0E4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB40ALP0C0E4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB40ALP0C0E4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB40ALP0C0E4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB40ALP0C0E4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB40ALP0C0E4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB40ALP0C0E4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB40ALP0C0E4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB40ALP0C0E4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB40ALP0C0E4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB40ALP0C0E4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB40ALP0C0E4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB40ALP0C0E4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB40ALP0C0E4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB40ALP0C0E4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB40ALP0C0E4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB40ALP0C0E4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB40ALP0C0E4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB40ALP0C0E4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB40ALP0C0E4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB40ALP0C0E4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB40ALP0C0E4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB40ALP0C0E4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB40ALP0C0E4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB40ALP0C0E4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB40ALP0C0E4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB40ALP0C0E4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB40ALP0C0E4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB40ALP0C0E4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB40ALP0C0E4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB40ALP0C0E4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB40ALP0C0E4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB40ALP0C0E4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB40ALP0C0E4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB40ALP0C0E4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB40ALP0C0E4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB40ALP0C0E4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB40ALP0C0E4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB40ALP0C0E4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB40ALP0C0E4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB40ALP0C0E4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB40ALP0C0E4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB40ALP0C0E4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms