Protein–RNA interactions for Protein: P0C091

FREM3, FRAS1-related extracellular matrix protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM3P0C091 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FREM3P0C091 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FREM3P0C091 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FREM3P0C091 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FREM3P0C091 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FREM3P0C091 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FREM3P0C091 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FREM3P0C091 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FREM3P0C091 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FREM3P0C091 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FREM3P0C091 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FREM3P0C091 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FREM3P0C091 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FREM3P0C091 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FREM3P0C091 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FREM3P0C091 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FREM3P0C091 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FREM3P0C091 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FREM3P0C091 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FREM3P0C091 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FREM3P0C091 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FREM3P0C091 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FREM3P0C091 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FREM3P0C091 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FREM3P0C091 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FREM3P0C091 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FREM3P0C091 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FREM3P0C091 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FREM3P0C091 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FREM3P0C091 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FREM3P0C091 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FREM3P0C091 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FREM3P0C091 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FREM3P0C091 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FREM3P0C091 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FREM3P0C091 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
FREM3P0C091 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FREM3P0C091 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FREM3P0C091 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FREM3P0C091 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FREM3P0C091 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FREM3P0C091 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FREM3P0C091 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FREM3P0C091 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FREM3P0C091 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FREM3P0C091 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FREM3P0C091 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FREM3P0C091 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FREM3P0C091 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FREM3P0C091 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FREM3P0C091 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FREM3P0C091 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FREM3P0C091 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FREM3P0C091 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FREM3P0C091 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FREM3P0C091 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FREM3P0C091 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FREM3P0C091 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FREM3P0C091 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FREM3P0C091 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FREM3P0C091 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FREM3P0C091 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FREM3P0C091 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FREM3P0C091 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FREM3P0C091 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FREM3P0C091 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FREM3P0C091 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FREM3P0C091 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FREM3P0C091 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FREM3P0C091 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FREM3P0C091 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FREM3P0C091 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FREM3P0C091 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FREM3P0C091 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FREM3P0C091 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FREM3P0C091 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FREM3P0C091 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FREM3P0C091 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FREM3P0C091 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FREM3P0C091 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FREM3P0C091 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FREM3P0C091 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FREM3P0C091 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FREM3P0C091 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FREM3P0C091 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FREM3P0C091 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FREM3P0C091 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FREM3P0C091 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FREM3P0C091 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FREM3P0C091 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FREM3P0C091 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FREM3P0C091 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FREM3P0C091 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FREM3P0C091 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FREM3P0C091 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FREM3P0C091 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FREM3P0C091 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FREM3P0C091 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FREM3P0C091 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FREM3P0C091 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms