Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NEFMP07197 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NEFMP07197 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
NEFMP07197 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NEFMP07197 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NEFMP07197 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
NEFMP07197 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NEFMP07197 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
NEFMP07197 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NEFMP07197 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NEFMP07197 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
NEFMP07197 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NEFMP07197 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NEFMP07197 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NEFMP07197 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NEFMP07197 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NEFMP07197 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
NEFMP07197 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NEFMP07197 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NEFMP07197 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NEFMP07197 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NEFMP07197 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NEFMP07197 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
NEFMP07197 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NEFMP07197 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
NEFMP07197 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NEFMP07197 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NEFMP07197 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NEFMP07197 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NEFMP07197 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NEFMP07197 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NEFMP07197 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
NEFMP07197 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NEFMP07197 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NEFMP07197 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NEFMP07197 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NEFMP07197 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NEFMP07197 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NEFMP07197 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NEFMP07197 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NEFMP07197 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NEFMP07197 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NEFMP07197 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NEFMP07197 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
NEFMP07197 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NEFMP07197 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NEFMP07197 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NEFMP07197 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NEFMP07197 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NEFMP07197 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
NEFMP07197 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
NEFMP07197 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
NEFMP07197 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
NEFMP07197 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
NEFMP07197 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
NEFMP07197 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
NEFMP07197 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NEFMP07197 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NEFMP07197 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NEFMP07197 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NEFMP07197 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NEFMP07197 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NEFMP07197 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NEFMP07197 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NEFMP07197 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NEFMP07197 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NEFMP07197 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NEFMP07197 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NEFMP07197 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
NEFMP07197 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NEFMP07197 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NEFMP07197 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NEFMP07197 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NEFMP07197 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NEFMP07197 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NEFMP07197 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NEFMP07197 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NEFMP07197 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NEFMP07197 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
NEFMP07197 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NEFMP07197 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NEFMP07197 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NEFMP07197 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NEFMP07197 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NEFMP07197 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NEFMP07197 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NEFMP07197 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NEFMP07197 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NEFMP07197 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NEFMP07197 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NEFMP07197 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NEFMP07197 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NEFMP07197 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NEFMP07197 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NEFMP07197 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NEFMP07197 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NEFMP07197 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NEFMP07197 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NEFMP07197 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
NEFMP07197 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms