Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK1P06493 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK1P06493 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK1P06493 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK1P06493 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK1P06493 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK1P06493 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK1P06493 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK1P06493 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK1P06493 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK1P06493 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK1P06493 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK1P06493 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK1P06493 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK1P06493 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK1P06493 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK1P06493 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK1P06493 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK1P06493 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK1P06493 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK1P06493 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK1P06493 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK1P06493 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK1P06493 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK1P06493 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK1P06493 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK1P06493 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK1P06493 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK1P06493 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK1P06493 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK1P06493 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK1P06493 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK1P06493 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK1P06493 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK1P06493 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK1P06493 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK1P06493 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK1P06493 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK1P06493 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK1P06493 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK1P06493 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK1P06493 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK1P06493 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK1P06493 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK1P06493 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK1P06493 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK1P06493 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK1P06493 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK1P06493 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK1P06493 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK1P06493 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK1P06493 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK1P06493 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK1P06493 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK1P06493 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK1P06493 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK1P06493 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK1P06493 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK1P06493 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK1P06493 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK1P06493 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK1P06493 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK1P06493 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK1P06493 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK1P06493 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK1P06493 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK1P06493 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK1P06493 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK1P06493 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK1P06493 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK1P06493 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK1P06493 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK1P06493 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK1P06493 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK1P06493 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK1P06493 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK1P06493 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK1P06493 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK1P06493 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK1P06493 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK1P06493 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK1P06493 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK1P06493 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK1P06493 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK1P06493 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK1P06493 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK1P06493 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK1P06493 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK1P06493 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK1P06493 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK1P06493 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK1P06493 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK1P06493 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK1P06493 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK1P06493 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK1P06493 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK1P06493 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK1P06493 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK1P06493 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK1P06493 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms