Protein–RNA interactions for Protein: P06307

CCK, Cholecystokinin, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKP06307 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKP06307 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKP06307 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKP06307 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKP06307 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKP06307 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKP06307 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKP06307 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKP06307 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKP06307 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKP06307 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKP06307 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKP06307 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKP06307 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKP06307 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKP06307 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKP06307 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKP06307 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKP06307 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKP06307 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKP06307 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKP06307 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCKP06307 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKP06307 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKP06307 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKP06307 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKP06307 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKP06307 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKP06307 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKP06307 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKP06307 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKP06307 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKP06307 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKP06307 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKP06307 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKP06307 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKP06307 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKP06307 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKP06307 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKP06307 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKP06307 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKP06307 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKP06307 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKP06307 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKP06307 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKP06307 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKP06307 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKP06307 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKP06307 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKP06307 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKP06307 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKP06307 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKP06307 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKP06307 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKP06307 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKP06307 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKP06307 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKP06307 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKP06307 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKP06307 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKP06307 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKP06307 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKP06307 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKP06307 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKP06307 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKP06307 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKP06307 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKP06307 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKP06307 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKP06307 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKP06307 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKP06307 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKP06307 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKP06307 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKP06307 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKP06307 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKP06307 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKP06307 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKP06307 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKP06307 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKP06307 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKP06307 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKP06307 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKP06307 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKP06307 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKP06307 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKP06307 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKP06307 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKP06307 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKP06307 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKP06307 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKP06307 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKP06307 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKP06307 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKP06307 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKP06307 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKP06307 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKP06307 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKP06307 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKP06307 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms