Protein–RNA interactions for Protein: P05771

PRKCB, Protein kinase C beta type, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCBP05771 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKCBP05771 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKCBP05771 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKCBP05771 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKCBP05771 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKCBP05771 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKCBP05771 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKCBP05771 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKCBP05771 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKCBP05771 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKCBP05771 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKCBP05771 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKCBP05771 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKCBP05771 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKCBP05771 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKCBP05771 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKCBP05771 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKCBP05771 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKCBP05771 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKCBP05771 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRKCBP05771 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRKCBP05771 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRKCBP05771 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRKCBP05771 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKCBP05771 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKCBP05771 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKCBP05771 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKCBP05771 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKCBP05771 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKCBP05771 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKCBP05771 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKCBP05771 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKCBP05771 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKCBP05771 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKCBP05771 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKCBP05771 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKCBP05771 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKCBP05771 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKCBP05771 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKCBP05771 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKCBP05771 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKCBP05771 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKCBP05771 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKCBP05771 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKCBP05771 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKCBP05771 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKCBP05771 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKCBP05771 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKCBP05771 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKCBP05771 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKCBP05771 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKCBP05771 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKCBP05771 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKCBP05771 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKCBP05771 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKCBP05771 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKCBP05771 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKCBP05771 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKCBP05771 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKCBP05771 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKCBP05771 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKCBP05771 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKCBP05771 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKCBP05771 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKCBP05771 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKCBP05771 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKCBP05771 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKCBP05771 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKCBP05771 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRKCBP05771 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRKCBP05771 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
PRKCBP05771 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRKCBP05771 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRKCBP05771 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKCBP05771 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKCBP05771 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKCBP05771 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKCBP05771 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKCBP05771 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCBP05771 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCBP05771 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCBP05771 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCBP05771 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCBP05771 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCBP05771 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCBP05771 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCBP05771 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCBP05771 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCBP05771 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCBP05771 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCBP05771 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCBP05771 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCBP05771 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCBP05771 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCBP05771 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKCBP05771 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKCBP05771 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKCBP05771 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKCBP05771 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRKCBP05771 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms