Protein–RNA interactions for Protein: P04118

CLPS, Colipase, humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPSP04118 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLPSP04118 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLPSP04118 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLPSP04118 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLPSP04118 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLPSP04118 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLPSP04118 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLPSP04118 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLPSP04118 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLPSP04118 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLPSP04118 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLPSP04118 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLPSP04118 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLPSP04118 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLPSP04118 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLPSP04118 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLPSP04118 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CLPSP04118 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CLPSP04118 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CLPSP04118 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CLPSP04118 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLPSP04118 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLPSP04118 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLPSP04118 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLPSP04118 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLPSP04118 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CLPSP04118 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLPSP04118 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLPSP04118 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLPSP04118 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLPSP04118 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLPSP04118 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLPSP04118 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLPSP04118 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLPSP04118 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CLPSP04118 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLPSP04118 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLPSP04118 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLPSP04118 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLPSP04118 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLPSP04118 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLPSP04118 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLPSP04118 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLPSP04118 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLPSP04118 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLPSP04118 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLPSP04118 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLPSP04118 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLPSP04118 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLPSP04118 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLPSP04118 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CLPSP04118 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLPSP04118 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLPSP04118 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLPSP04118 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLPSP04118 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLPSP04118 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLPSP04118 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLPSP04118 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLPSP04118 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLPSP04118 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLPSP04118 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLPSP04118 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLPSP04118 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLPSP04118 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLPSP04118 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLPSP04118 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLPSP04118 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLPSP04118 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLPSP04118 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLPSP04118 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLPSP04118 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLPSP04118 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLPSP04118 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLPSP04118 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLPSP04118 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLPSP04118 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLPSP04118 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLPSP04118 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLPSP04118 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLPSP04118 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLPSP04118 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLPSP04118 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLPSP04118 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CLPSP04118 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLPSP04118 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLPSP04118 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLPSP04118 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLPSP04118 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLPSP04118 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLPSP04118 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLPSP04118 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLPSP04118 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLPSP04118 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLPSP04118 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLPSP04118 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLPSP04118 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLPSP04118 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLPSP04118 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLPSP04118 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms