Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SEC24BO95487 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SEC24BO95487 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SEC24BO95487 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SEC24BO95487 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SEC24BO95487 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SEC24BO95487 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SEC24BO95487 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SEC24BO95487 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SEC24BO95487 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SEC24BO95487 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SEC24BO95487 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SEC24BO95487 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SEC24BO95487 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SEC24BO95487 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SEC24BO95487 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SEC24BO95487 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SEC24BO95487 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SEC24BO95487 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SEC24BO95487 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SEC24BO95487 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SEC24BO95487 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SEC24BO95487 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
SEC24BO95487 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SEC24BO95487 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SEC24BO95487 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SEC24BO95487 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SEC24BO95487 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SEC24BO95487 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
SEC24BO95487 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SEC24BO95487 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SEC24BO95487 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SEC24BO95487 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SEC24BO95487 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SEC24BO95487 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SEC24BO95487 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SEC24BO95487 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SEC24BO95487 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SEC24BO95487 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SEC24BO95487 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SEC24BO95487 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SEC24BO95487 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SEC24BO95487 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SEC24BO95487 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SEC24BO95487 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SEC24BO95487 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SEC24BO95487 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SEC24BO95487 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SEC24BO95487 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SEC24BO95487 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SEC24BO95487 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SEC24BO95487 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SEC24BO95487 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SEC24BO95487 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SEC24BO95487 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SEC24BO95487 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SEC24BO95487 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SEC24BO95487 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SEC24BO95487 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SEC24BO95487 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
SEC24BO95487 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SEC24BO95487 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SEC24BO95487 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SEC24BO95487 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SEC24BO95487 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SEC24BO95487 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SEC24BO95487 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SEC24BO95487 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SEC24BO95487 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SEC24BO95487 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SEC24BO95487 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SEC24BO95487 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SEC24BO95487 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SEC24BO95487 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SEC24BO95487 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SEC24BO95487 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SEC24BO95487 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SEC24BO95487 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SEC24BO95487 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SEC24BO95487 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SEC24BO95487 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SEC24BO95487 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SEC24BO95487 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SEC24BO95487 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SEC24BO95487 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SEC24BO95487 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SEC24BO95487 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SEC24BO95487 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
SEC24BO95487 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SEC24BO95487 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SEC24BO95487 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SEC24BO95487 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SEC24BO95487 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SEC24BO95487 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SEC24BO95487 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SEC24BO95487 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SEC24BO95487 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SEC24BO95487 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SEC24BO95487 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SEC24BO95487 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms