Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
USP19O94966 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
USP19O94966 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
USP19O94966 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
USP19O94966 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
USP19O94966 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
USP19O94966 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
USP19O94966 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
USP19O94966 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
USP19O94966 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
USP19O94966 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
USP19O94966 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
USP19O94966 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
USP19O94966 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
USP19O94966 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
USP19O94966 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
USP19O94966 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
USP19O94966 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
USP19O94966 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
USP19O94966 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
USP19O94966 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
USP19O94966 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
USP19O94966 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
USP19O94966 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
USP19O94966 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
USP19O94966 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
USP19O94966 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
USP19O94966 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
USP19O94966 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
USP19O94966 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
USP19O94966 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
USP19O94966 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
USP19O94966 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
USP19O94966 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
USP19O94966 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
USP19O94966 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
USP19O94966 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
USP19O94966 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
USP19O94966 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
USP19O94966 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
USP19O94966 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
USP19O94966 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
USP19O94966 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
USP19O94966 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
USP19O94966 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.79■■■■□ 3
USP19O94966 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.79■■■■□ 3
USP19O94966 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.79■■■■□ 3
USP19O94966 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
USP19O94966 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
USP19O94966 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
USP19O94966 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
USP19O94966 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
USP19O94966 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
USP19O94966 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
USP19O94966 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
USP19O94966 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.77■■■■□ 3
USP19O94966 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
USP19O94966 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
USP19O94966 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
USP19O94966 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
USP19O94966 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
USP19O94966 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
USP19O94966 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
USP19O94966 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
USP19O94966 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
USP19O94966 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
USP19O94966 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
USP19O94966 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
USP19O94966 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
USP19O94966 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
USP19O94966 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
USP19O94966 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
USP19O94966 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
USP19O94966 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
USP19O94966 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
USP19O94966 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
USP19O94966 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
USP19O94966 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
USP19O94966 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
USP19O94966 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
USP19O94966 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
USP19O94966 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
USP19O94966 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
USP19O94966 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
USP19O94966 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
USP19O94966 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
USP19O94966 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
USP19O94966 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
USP19O94966 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
USP19O94966 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
USP19O94966 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
USP19O94966 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
USP19O94966 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
USP19O94966 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
USP19O94966 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
USP19O94966 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
USP19O94966 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
USP19O94966 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
USP19O94966 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
USP19O94966 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms