Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GADD45BO75293 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GADD45BO75293 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GADD45BO75293 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GADD45BO75293 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GADD45BO75293 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GADD45BO75293 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GADD45BO75293 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GADD45BO75293 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GADD45BO75293 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GADD45BO75293 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GADD45BO75293 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GADD45BO75293 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GADD45BO75293 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GADD45BO75293 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GADD45BO75293 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GADD45BO75293 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GADD45BO75293 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GADD45BO75293 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GADD45BO75293 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GADD45BO75293 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GADD45BO75293 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GADD45BO75293 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GADD45BO75293 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GADD45BO75293 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GADD45BO75293 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GADD45BO75293 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GADD45BO75293 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GADD45BO75293 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GADD45BO75293 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GADD45BO75293 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GADD45BO75293 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GADD45BO75293 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GADD45BO75293 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GADD45BO75293 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GADD45BO75293 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GADD45BO75293 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GADD45BO75293 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GADD45BO75293 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GADD45BO75293 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GADD45BO75293 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GADD45BO75293 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GADD45BO75293 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GADD45BO75293 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GADD45BO75293 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GADD45BO75293 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GADD45BO75293 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GADD45BO75293 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GADD45BO75293 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GADD45BO75293 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GADD45BO75293 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GADD45BO75293 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
GADD45BO75293 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GADD45BO75293 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GADD45BO75293 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GADD45BO75293 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GADD45BO75293 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GADD45BO75293 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GADD45BO75293 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GADD45BO75293 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GADD45BO75293 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GADD45BO75293 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GADD45BO75293 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GADD45BO75293 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GADD45BO75293 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GADD45BO75293 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GADD45BO75293 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GADD45BO75293 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GADD45BO75293 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GADD45BO75293 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GADD45BO75293 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GADD45BO75293 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GADD45BO75293 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GADD45BO75293 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GADD45BO75293 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GADD45BO75293 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GADD45BO75293 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GADD45BO75293 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GADD45BO75293 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GADD45BO75293 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GADD45BO75293 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GADD45BO75293 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GADD45BO75293 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GADD45BO75293 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GADD45BO75293 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GADD45BO75293 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GADD45BO75293 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GADD45BO75293 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GADD45BO75293 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GADD45BO75293 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GADD45BO75293 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GADD45BO75293 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GADD45BO75293 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GADD45BO75293 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GADD45BO75293 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GADD45BO75293 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GADD45BO75293 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GADD45BO75293 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GADD45BO75293 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GADD45BO75293 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms