Protein–RNA interactions for Protein: O75200

NPIPB7, Nuclear pore complex-interacting protein family member B7, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB7O75200 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPB7O75200 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPB7O75200 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPB7O75200 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPB7O75200 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPB7O75200 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPB7O75200 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPB7O75200 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPB7O75200 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPB7O75200 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPB7O75200 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPB7O75200 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPB7O75200 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPB7O75200 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPB7O75200 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPB7O75200 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPB7O75200 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPB7O75200 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPB7O75200 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPB7O75200 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPB7O75200 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPB7O75200 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPB7O75200 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPB7O75200 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPB7O75200 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPB7O75200 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPB7O75200 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPB7O75200 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPB7O75200 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPB7O75200 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPB7O75200 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPIPB7O75200 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPIPB7O75200 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPIPB7O75200 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPIPB7O75200 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPIPB7O75200 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPIPB7O75200 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPIPB7O75200 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPIPB7O75200 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPB7O75200 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPB7O75200 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPIPB7O75200 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPIPB7O75200 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPB7O75200 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPB7O75200 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPB7O75200 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPB7O75200 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NPIPB7O75200 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPIPB7O75200 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPIPB7O75200 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPIPB7O75200 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPIPB7O75200 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPIPB7O75200 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPIPB7O75200 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPIPB7O75200 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPIPB7O75200 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPIPB7O75200 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPIPB7O75200 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPIPB7O75200 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPIPB7O75200 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPIPB7O75200 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPIPB7O75200 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPIPB7O75200 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPIPB7O75200 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPB7O75200 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPB7O75200 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPB7O75200 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPB7O75200 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPB7O75200 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPB7O75200 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPIPB7O75200 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPIPB7O75200 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPIPB7O75200 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPIPB7O75200 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPIPB7O75200 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPIPB7O75200 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPIPB7O75200 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPB7O75200 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPB7O75200 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPB7O75200 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPB7O75200 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPB7O75200 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPB7O75200 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPB7O75200 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPB7O75200 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPB7O75200 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPB7O75200 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPB7O75200 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPB7O75200 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPB7O75200 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPIPB7O75200 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPIPB7O75200 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPIPB7O75200 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPIPB7O75200 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPIPB7O75200 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPIPB7O75200 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPIPB7O75200 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPIPB7O75200 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NPIPB7O75200 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPIPB7O75200 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms