Protein–RNA interactions for Protein: O75177

SS18L1, Calcium-responsive transactivator, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L1O75177 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SS18L1O75177 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SS18L1O75177 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SS18L1O75177 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SS18L1O75177 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SS18L1O75177 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SS18L1O75177 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SS18L1O75177 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SS18L1O75177 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SS18L1O75177 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SS18L1O75177 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SS18L1O75177 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SS18L1O75177 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SS18L1O75177 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SS18L1O75177 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SS18L1O75177 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SS18L1O75177 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SS18L1O75177 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SS18L1O75177 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SS18L1O75177 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SS18L1O75177 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SS18L1O75177 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SS18L1O75177 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SS18L1O75177 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SS18L1O75177 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SS18L1O75177 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SS18L1O75177 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SS18L1O75177 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SS18L1O75177 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SS18L1O75177 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SS18L1O75177 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SS18L1O75177 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SS18L1O75177 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SS18L1O75177 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SS18L1O75177 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SS18L1O75177 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SS18L1O75177 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SS18L1O75177 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SS18L1O75177 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SS18L1O75177 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SS18L1O75177 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SS18L1O75177 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SS18L1O75177 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SS18L1O75177 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SS18L1O75177 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SS18L1O75177 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SS18L1O75177 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SS18L1O75177 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SS18L1O75177 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SS18L1O75177 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SS18L1O75177 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SS18L1O75177 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SS18L1O75177 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SS18L1O75177 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SS18L1O75177 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SS18L1O75177 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SS18L1O75177 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SS18L1O75177 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SS18L1O75177 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms