Protein–RNA interactions for Protein: O60806

TBX19, T-box transcription factor TBX19, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX19O60806 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TBX19O60806 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TBX19O60806 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TBX19O60806 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TBX19O60806 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TBX19O60806 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TBX19O60806 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TBX19O60806 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TBX19O60806 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TBX19O60806 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TBX19O60806 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TBX19O60806 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TBX19O60806 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TBX19O60806 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TBX19O60806 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TBX19O60806 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TBX19O60806 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TBX19O60806 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TBX19O60806 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TBX19O60806 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TBX19O60806 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TBX19O60806 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TBX19O60806 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TBX19O60806 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TBX19O60806 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TBX19O60806 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TBX19O60806 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBX19O60806 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBX19O60806 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBX19O60806 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBX19O60806 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBX19O60806 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBX19O60806 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBX19O60806 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBX19O60806 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBX19O60806 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TBX19O60806 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TBX19O60806 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TBX19O60806 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBX19O60806 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBX19O60806 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TBX19O60806 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX19O60806 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX19O60806 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX19O60806 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX19O60806 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TBX19O60806 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TBX19O60806 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TBX19O60806 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TBX19O60806 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TBX19O60806 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TBX19O60806 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TBX19O60806 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TBX19O60806 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TBX19O60806 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBX19O60806 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBX19O60806 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBX19O60806 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBX19O60806 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBX19O60806 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBX19O60806 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBX19O60806 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBX19O60806 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBX19O60806 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBX19O60806 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBX19O60806 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBX19O60806 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBX19O60806 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBX19O60806 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBX19O60806 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBX19O60806 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBX19O60806 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBX19O60806 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBX19O60806 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBX19O60806 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TBX19O60806 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBX19O60806 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TBX19O60806 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBX19O60806 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBX19O60806 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBX19O60806 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBX19O60806 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBX19O60806 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBX19O60806 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBX19O60806 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TBX19O60806 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TBX19O60806 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TBX19O60806 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TBX19O60806 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TBX19O60806 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TBX19O60806 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TBX19O60806 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TBX19O60806 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TBX19O60806 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TBX19O60806 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TBX19O60806 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TBX19O60806 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TBX19O60806 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TBX19O60806 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBX19O60806 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms