Protein–RNA interactions for Protein: O60687

SRPX2, Sushi repeat-containing protein SRPX2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPX2O60687 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRPX2O60687 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRPX2O60687 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPX2O60687 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPX2O60687 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPX2O60687 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPX2O60687 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRPX2O60687 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRPX2O60687 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRPX2O60687 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRPX2O60687 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRPX2O60687 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPX2O60687 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPX2O60687 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPX2O60687 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPX2O60687 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPX2O60687 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPX2O60687 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPX2O60687 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPX2O60687 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPX2O60687 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPX2O60687 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPX2O60687 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPX2O60687 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRPX2O60687 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRPX2O60687 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRPX2O60687 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRPX2O60687 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPX2O60687 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPX2O60687 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPX2O60687 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPX2O60687 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPX2O60687 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPX2O60687 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPX2O60687 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPX2O60687 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRPX2O60687 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRPX2O60687 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRPX2O60687 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRPX2O60687 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRPX2O60687 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRPX2O60687 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRPX2O60687 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRPX2O60687 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SRPX2O60687 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRPX2O60687 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRPX2O60687 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRPX2O60687 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRPX2O60687 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRPX2O60687 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRPX2O60687 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRPX2O60687 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRPX2O60687 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SRPX2O60687 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRPX2O60687 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SRPX2O60687 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRPX2O60687 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRPX2O60687 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SRPX2O60687 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRPX2O60687 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRPX2O60687 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRPX2O60687 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRPX2O60687 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPX2O60687 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPX2O60687 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPX2O60687 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPX2O60687 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPX2O60687 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPX2O60687 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPX2O60687 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPX2O60687 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPX2O60687 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPX2O60687 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPX2O60687 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPX2O60687 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPX2O60687 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPX2O60687 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPX2O60687 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPX2O60687 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRPX2O60687 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRPX2O60687 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRPX2O60687 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SRPX2O60687 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRPX2O60687 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRPX2O60687 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRPX2O60687 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SRPX2O60687 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRPX2O60687 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPX2O60687 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPX2O60687 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPX2O60687 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPX2O60687 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPX2O60687 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPX2O60687 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPX2O60687 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPX2O60687 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPX2O60687 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRPX2O60687 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRPX2O60687 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRPX2O60687 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms