Protein–RNA interactions for Protein: O60260

PRKN, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKNO60260 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKNO60260 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKNO60260 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKNO60260 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKNO60260 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKNO60260 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKNO60260 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKNO60260 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKNO60260 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKNO60260 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKNO60260 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKNO60260 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKNO60260 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKNO60260 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKNO60260 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKNO60260 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKNO60260 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKNO60260 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKNO60260 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKNO60260 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKNO60260 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKNO60260 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKNO60260 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKNO60260 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKNO60260 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKNO60260 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKNO60260 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKNO60260 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKNO60260 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKNO60260 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKNO60260 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKNO60260 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKNO60260 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKNO60260 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKNO60260 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKNO60260 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKNO60260 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKNO60260 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKNO60260 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKNO60260 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKNO60260 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKNO60260 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKNO60260 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKNO60260 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKNO60260 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKNO60260 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKNO60260 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKNO60260 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRKNO60260 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKNO60260 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKNO60260 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKNO60260 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKNO60260 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKNO60260 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKNO60260 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKNO60260 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKNO60260 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKNO60260 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKNO60260 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKNO60260 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKNO60260 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKNO60260 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKNO60260 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKNO60260 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKNO60260 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKNO60260 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKNO60260 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKNO60260 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKNO60260 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKNO60260 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKNO60260 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKNO60260 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKNO60260 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKNO60260 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKNO60260 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKNO60260 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKNO60260 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKNO60260 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKNO60260 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKNO60260 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKNO60260 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKNO60260 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKNO60260 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKNO60260 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKNO60260 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKNO60260 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKNO60260 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKNO60260 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKNO60260 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKNO60260 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKNO60260 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKNO60260 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKNO60260 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKNO60260 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRKNO60260 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKNO60260 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKNO60260 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKNO60260 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKNO60260 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKNO60260 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms