Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP9BO43861 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP9BO43861 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP9BO43861 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP9BO43861 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP9BO43861 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP9BO43861 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP9BO43861 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP9BO43861 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP9BO43861 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP9BO43861 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP9BO43861 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP9BO43861 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP9BO43861 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP9BO43861 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP9BO43861 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP9BO43861 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP9BO43861 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP9BO43861 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP9BO43861 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP9BO43861 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP9BO43861 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP9BO43861 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP9BO43861 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP9BO43861 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP9BO43861 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP9BO43861 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP9BO43861 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP9BO43861 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP9BO43861 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP9BO43861 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP9BO43861 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP9BO43861 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP9BO43861 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP9BO43861 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP9BO43861 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP9BO43861 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP9BO43861 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP9BO43861 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP9BO43861 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP9BO43861 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP9BO43861 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP9BO43861 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP9BO43861 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATP9BO43861 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATP9BO43861 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATP9BO43861 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP9BO43861 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP9BO43861 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP9BO43861 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP9BO43861 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP9BO43861 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP9BO43861 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP9BO43861 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP9BO43861 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP9BO43861 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP9BO43861 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP9BO43861 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP9BO43861 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP9BO43861 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP9BO43861 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP9BO43861 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP9BO43861 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP9BO43861 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP9BO43861 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP9BO43861 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP9BO43861 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP9BO43861 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP9BO43861 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP9BO43861 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP9BO43861 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP9BO43861 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP9BO43861 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP9BO43861 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP9BO43861 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP9BO43861 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP9BO43861 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP9BO43861 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP9BO43861 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP9BO43861 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP9BO43861 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP9BO43861 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP9BO43861 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP9BO43861 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP9BO43861 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP9BO43861 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP9BO43861 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP9BO43861 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP9BO43861 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP9BO43861 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP9BO43861 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP9BO43861 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP9BO43861 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP9BO43861 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP9BO43861 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP9BO43861 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP9BO43861 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP9BO43861 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP9BO43861 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP9BO43861 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms