Protein–RNA interactions for Protein: O15379

HDAC3, Histone deacetylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3O15379 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC3O15379 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC3O15379 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC3O15379 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC3O15379 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC3O15379 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC3O15379 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC3O15379 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC3O15379 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC3O15379 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC3O15379 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC3O15379 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC3O15379 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC3O15379 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC3O15379 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC3O15379 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC3O15379 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HDAC3O15379 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC3O15379 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC3O15379 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC3O15379 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC3O15379 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC3O15379 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC3O15379 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC3O15379 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC3O15379 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC3O15379 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC3O15379 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC3O15379 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC3O15379 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC3O15379 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC3O15379 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC3O15379 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC3O15379 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC3O15379 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC3O15379 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC3O15379 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC3O15379 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC3O15379 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC3O15379 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC3O15379 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC3O15379 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC3O15379 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HDAC3O15379 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC3O15379 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC3O15379 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC3O15379 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC3O15379 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC3O15379 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC3O15379 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC3O15379 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC3O15379 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC3O15379 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC3O15379 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC3O15379 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC3O15379 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC3O15379 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC3O15379 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC3O15379 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC3O15379 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC3O15379 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC3O15379 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC3O15379 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC3O15379 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC3O15379 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC3O15379 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC3O15379 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC3O15379 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC3O15379 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC3O15379 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC3O15379 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC3O15379 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC3O15379 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC3O15379 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC3O15379 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC3O15379 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC3O15379 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC3O15379 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC3O15379 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC3O15379 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HDAC3O15379 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC3O15379 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC3O15379 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC3O15379 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC3O15379 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC3O15379 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC3O15379 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC3O15379 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC3O15379 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC3O15379 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC3O15379 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC3O15379 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC3O15379 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC3O15379 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC3O15379 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC3O15379 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC3O15379 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC3O15379 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC3O15379 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC3O15379 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms