Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
IFIT3O14879 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
IFIT3O14879 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
IFIT3O14879 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IFIT3O14879 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IFIT3O14879 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
IFIT3O14879 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
IFIT3O14879 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
IFIT3O14879 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
IFIT3O14879 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
IFIT3O14879 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
IFIT3O14879 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
IFIT3O14879 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
IFIT3O14879 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IFIT3O14879 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
IFIT3O14879 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
IFIT3O14879 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
IFIT3O14879 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IFIT3O14879 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IFIT3O14879 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
IFIT3O14879 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
IFIT3O14879 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
IFIT3O14879 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
IFIT3O14879 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
IFIT3O14879 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
IFIT3O14879 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
IFIT3O14879 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
IFIT3O14879 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFIT3O14879 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFIT3O14879 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFIT3O14879 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFIT3O14879 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
IFIT3O14879 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFIT3O14879 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFIT3O14879 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFIT3O14879 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFIT3O14879 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFIT3O14879 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFIT3O14879 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFIT3O14879 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFIT3O14879 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFIT3O14879 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFIT3O14879 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFIT3O14879 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFIT3O14879 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
IFIT3O14879 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFIT3O14879 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFIT3O14879 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFIT3O14879 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFIT3O14879 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFIT3O14879 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFIT3O14879 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFIT3O14879 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IFIT3O14879 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IFIT3O14879 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
IFIT3O14879 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IFIT3O14879 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFIT3O14879 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFIT3O14879 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFIT3O14879 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFIT3O14879 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFIT3O14879 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFIT3O14879 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFIT3O14879 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
IFIT3O14879 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
IFIT3O14879 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFIT3O14879 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFIT3O14879 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFIT3O14879 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFIT3O14879 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFIT3O14879 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
IFIT3O14879 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFIT3O14879 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
IFIT3O14879 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFIT3O14879 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFIT3O14879 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFIT3O14879 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFIT3O14879 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IFIT3O14879 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
IFIT3O14879 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IFIT3O14879 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IFIT3O14879 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
IFIT3O14879 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29■■■□□ 2.23
IFIT3O14879 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
IFIT3O14879 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29■■■□□ 2.23
IFIT3O14879 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IFIT3O14879 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IFIT3O14879 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
IFIT3O14879 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFIT3O14879 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFIT3O14879 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFIT3O14879 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
IFIT3O14879 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IFIT3O14879 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
IFIT3O14879 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
IFIT3O14879 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
IFIT3O14879 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
IFIT3O14879 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
IFIT3O14879 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
IFIT3O14879 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms