Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GFRA2O00451 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GFRA2O00451 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GFRA2O00451 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GFRA2O00451 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GFRA2O00451 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GFRA2O00451 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GFRA2O00451 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GFRA2O00451 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GFRA2O00451 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GFRA2O00451 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GFRA2O00451 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GFRA2O00451 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GFRA2O00451 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GFRA2O00451 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GFRA2O00451 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GFRA2O00451 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GFRA2O00451 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GFRA2O00451 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GFRA2O00451 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GFRA2O00451 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GFRA2O00451 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GFRA2O00451 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GFRA2O00451 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GFRA2O00451 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GFRA2O00451 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GFRA2O00451 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GFRA2O00451 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GFRA2O00451 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GFRA2O00451 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GFRA2O00451 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GFRA2O00451 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GFRA2O00451 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GFRA2O00451 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GFRA2O00451 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GFRA2O00451 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GFRA2O00451 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GFRA2O00451 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GFRA2O00451 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GFRA2O00451 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GFRA2O00451 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GFRA2O00451 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GFRA2O00451 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GFRA2O00451 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GFRA2O00451 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GFRA2O00451 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GFRA2O00451 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GFRA2O00451 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GFRA2O00451 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GFRA2O00451 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GFRA2O00451 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GFRA2O00451 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GFRA2O00451 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GFRA2O00451 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GFRA2O00451 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GFRA2O00451 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GFRA2O00451 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GFRA2O00451 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GFRA2O00451 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms