Protein–RNA interactions for Protein: O00421

CCRL2, C-C chemokine receptor-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCRL2O00421 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCRL2O00421 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCRL2O00421 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCRL2O00421 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCRL2O00421 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCRL2O00421 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCRL2O00421 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCRL2O00421 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCRL2O00421 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCRL2O00421 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCRL2O00421 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCRL2O00421 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCRL2O00421 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCRL2O00421 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCRL2O00421 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCRL2O00421 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCRL2O00421 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCRL2O00421 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCRL2O00421 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCRL2O00421 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCRL2O00421 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCRL2O00421 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCRL2O00421 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCRL2O00421 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCRL2O00421 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCRL2O00421 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCRL2O00421 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCRL2O00421 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCRL2O00421 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCRL2O00421 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCRL2O00421 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCRL2O00421 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCRL2O00421 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCRL2O00421 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCRL2O00421 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCRL2O00421 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCRL2O00421 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCRL2O00421 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCRL2O00421 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCRL2O00421 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCRL2O00421 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCRL2O00421 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCRL2O00421 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCRL2O00421 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCRL2O00421 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCRL2O00421 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCRL2O00421 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCRL2O00421 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCRL2O00421 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCRL2O00421 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCRL2O00421 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCRL2O00421 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCRL2O00421 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCRL2O00421 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCRL2O00421 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCRL2O00421 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCRL2O00421 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCRL2O00421 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCRL2O00421 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCRL2O00421 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCRL2O00421 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCRL2O00421 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCRL2O00421 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCRL2O00421 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCRL2O00421 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCRL2O00421 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCRL2O00421 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCRL2O00421 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCRL2O00421 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCRL2O00421 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCRL2O00421 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCRL2O00421 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCRL2O00421 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCRL2O00421 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCRL2O00421 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCRL2O00421 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCRL2O00421 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCRL2O00421 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCRL2O00421 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCRL2O00421 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCRL2O00421 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCRL2O00421 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCRL2O00421 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCRL2O00421 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCRL2O00421 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCRL2O00421 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCRL2O00421 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCRL2O00421 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCRL2O00421 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCRL2O00421 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCRL2O00421 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCRL2O00421 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCRL2O00421 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCRL2O00421 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCRL2O00421 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCRL2O00421 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCRL2O00421 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCRL2O00421 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCRL2O00421 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCRL2O00421 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms