Protein–RNA interactions for Protein: O00148

DDX39A, ATP-dependent RNA helicase DDX39A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39AO00148 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX39AO00148 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX39AO00148 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX39AO00148 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX39AO00148 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX39AO00148 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
DDX39AO00148 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DDX39AO00148 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX39AO00148 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX39AO00148 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX39AO00148 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX39AO00148 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX39AO00148 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX39AO00148 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX39AO00148 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX39AO00148 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX39AO00148 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX39AO00148 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX39AO00148 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX39AO00148 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX39AO00148 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX39AO00148 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX39AO00148 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX39AO00148 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX39AO00148 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX39AO00148 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX39AO00148 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX39AO00148 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX39AO00148 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX39AO00148 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX39AO00148 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
DDX39AO00148 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
DDX39AO00148 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX39AO00148 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX39AO00148 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX39AO00148 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX39AO00148 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX39AO00148 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX39AO00148 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX39AO00148 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX39AO00148 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX39AO00148 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX39AO00148 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX39AO00148 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX39AO00148 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX39AO00148 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX39AO00148 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX39AO00148 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX39AO00148 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX39AO00148 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX39AO00148 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX39AO00148 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX39AO00148 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX39AO00148 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX39AO00148 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX39AO00148 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX39AO00148 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX39AO00148 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX39AO00148 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX39AO00148 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX39AO00148 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX39AO00148 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX39AO00148 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX39AO00148 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX39AO00148 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX39AO00148 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX39AO00148 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX39AO00148 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX39AO00148 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX39AO00148 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX39AO00148 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX39AO00148 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX39AO00148 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX39AO00148 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX39AO00148 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX39AO00148 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX39AO00148 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX39AO00148 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX39AO00148 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX39AO00148 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX39AO00148 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX39AO00148 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX39AO00148 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX39AO00148 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX39AO00148 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX39AO00148 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX39AO00148 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX39AO00148 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX39AO00148 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX39AO00148 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX39AO00148 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX39AO00148 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX39AO00148 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX39AO00148 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX39AO00148 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX39AO00148 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX39AO00148 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX39AO00148 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX39AO00148 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX39AO00148 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms