Protein–RNA interactions for Protein: H6UMI1

GABARAP, GABARAP-a, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPH6UMI1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABARAPH6UMI1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABARAPH6UMI1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GABARAPH6UMI1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABARAPH6UMI1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABARAPH6UMI1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABARAPH6UMI1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABARAPH6UMI1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABARAPH6UMI1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABARAPH6UMI1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABARAPH6UMI1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABARAPH6UMI1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABARAPH6UMI1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABARAPH6UMI1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABARAPH6UMI1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABARAPH6UMI1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABARAPH6UMI1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GABARAPH6UMI1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABARAPH6UMI1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABARAPH6UMI1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABARAPH6UMI1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABARAPH6UMI1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABARAPH6UMI1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABARAPH6UMI1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABARAPH6UMI1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABARAPH6UMI1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABARAPH6UMI1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABARAPH6UMI1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABARAPH6UMI1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABARAPH6UMI1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABARAPH6UMI1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABARAPH6UMI1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABARAPH6UMI1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABARAPH6UMI1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GABARAPH6UMI1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABARAPH6UMI1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABARAPH6UMI1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABARAPH6UMI1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABARAPH6UMI1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABARAPH6UMI1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABARAPH6UMI1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABARAPH6UMI1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABARAPH6UMI1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GABARAPH6UMI1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABARAPH6UMI1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABARAPH6UMI1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABARAPH6UMI1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABARAPH6UMI1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABARAPH6UMI1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABARAPH6UMI1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABARAPH6UMI1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABARAPH6UMI1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GABARAPH6UMI1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABARAPH6UMI1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms