Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ERVV-2B6SEH9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ERVV-2B6SEH9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ERVV-2B6SEH9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ERVV-2B6SEH9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ERVV-2B6SEH9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ERVV-2B6SEH9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ERVV-2B6SEH9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ERVV-2B6SEH9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ERVV-2B6SEH9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ERVV-2B6SEH9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ERVV-2B6SEH9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ERVV-2B6SEH9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ERVV-2B6SEH9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ERVV-2B6SEH9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ERVV-2B6SEH9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
ERVV-2B6SEH9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ERVV-2B6SEH9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ERVV-2B6SEH9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ERVV-2B6SEH9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ERVV-2B6SEH9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ERVV-2B6SEH9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ERVV-2B6SEH9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ERVV-2B6SEH9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ERVV-2B6SEH9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
ERVV-2B6SEH9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
ERVV-2B6SEH9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ERVV-2B6SEH9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ERVV-2B6SEH9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
ERVV-2B6SEH9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
ERVV-2B6SEH9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ERVV-2B6SEH9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ERVV-2B6SEH9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
ERVV-2B6SEH9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ERVV-2B6SEH9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ERVV-2B6SEH9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ERVV-2B6SEH9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ERVV-2B6SEH9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ERVV-2B6SEH9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ERVV-2B6SEH9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ERVV-2B6SEH9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ERVV-2B6SEH9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ERVV-2B6SEH9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ERVV-2B6SEH9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ERVV-2B6SEH9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ERVV-2B6SEH9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ERVV-2B6SEH9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ERVV-2B6SEH9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ERVV-2B6SEH9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ERVV-2B6SEH9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ERVV-2B6SEH9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ERVV-2B6SEH9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
ERVV-2B6SEH9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ERVV-2B6SEH9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ERVV-2B6SEH9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ERVV-2B6SEH9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ERVV-2B6SEH9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ERVV-2B6SEH9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ERVV-2B6SEH9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ERVV-2B6SEH9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ERVV-2B6SEH9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ERVV-2B6SEH9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ERVV-2B6SEH9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
ERVV-2B6SEH9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ERVV-2B6SEH9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ERVV-2B6SEH9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ERVV-2B6SEH9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ERVV-2B6SEH9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ERVV-2B6SEH9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ERVV-2B6SEH9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ERVV-2B6SEH9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ERVV-2B6SEH9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ERVV-2B6SEH9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ERVV-2B6SEH9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ERVV-2B6SEH9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ERVV-2B6SEH9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ERVV-2B6SEH9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
ERVV-2B6SEH9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ERVV-2B6SEH9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ERVV-2B6SEH9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
ERVV-2B6SEH9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ERVV-2B6SEH9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ERVV-2B6SEH9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ERVV-2B6SEH9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
ERVV-2B6SEH9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
ERVV-2B6SEH9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ERVV-2B6SEH9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ERVV-2B6SEH9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ERVV-2B6SEH9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ERVV-2B6SEH9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
ERVV-2B6SEH9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ERVV-2B6SEH9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ERVV-2B6SEH9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ERVV-2B6SEH9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ERVV-2B6SEH9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ERVV-2B6SEH9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ERVV-2B6SEH9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
ERVV-2B6SEH9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ERVV-2B6SEH9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ERVV-2B6SEH9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
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