Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HACD1B0YJ81 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HACD1B0YJ81 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HACD1B0YJ81 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HACD1B0YJ81 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HACD1B0YJ81 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HACD1B0YJ81 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HACD1B0YJ81 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HACD1B0YJ81 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HACD1B0YJ81 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HACD1B0YJ81 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HACD1B0YJ81 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HACD1B0YJ81 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HACD1B0YJ81 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HACD1B0YJ81 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HACD1B0YJ81 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HACD1B0YJ81 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HACD1B0YJ81 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HACD1B0YJ81 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HACD1B0YJ81 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HACD1B0YJ81 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HACD1B0YJ81 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HACD1B0YJ81 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HACD1B0YJ81 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HACD1B0YJ81 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HACD1B0YJ81 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HACD1B0YJ81 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HACD1B0YJ81 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HACD1B0YJ81 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HACD1B0YJ81 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HACD1B0YJ81 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HACD1B0YJ81 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HACD1B0YJ81 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HACD1B0YJ81 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HACD1B0YJ81 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HACD1B0YJ81 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HACD1B0YJ81 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HACD1B0YJ81 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HACD1B0YJ81 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HACD1B0YJ81 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HACD1B0YJ81 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HACD1B0YJ81 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HACD1B0YJ81 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HACD1B0YJ81 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HACD1B0YJ81 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HACD1B0YJ81 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HACD1B0YJ81 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HACD1B0YJ81 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HACD1B0YJ81 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HACD1B0YJ81 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HACD1B0YJ81 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HACD1B0YJ81 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HACD1B0YJ81 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HACD1B0YJ81 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HACD1B0YJ81 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HACD1B0YJ81 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HACD1B0YJ81 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HACD1B0YJ81 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HACD1B0YJ81 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HACD1B0YJ81 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HACD1B0YJ81 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HACD1B0YJ81 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HACD1B0YJ81 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HACD1B0YJ81 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HACD1B0YJ81 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HACD1B0YJ81 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HACD1B0YJ81 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HACD1B0YJ81 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HACD1B0YJ81 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HACD1B0YJ81 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HACD1B0YJ81 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HACD1B0YJ81 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HACD1B0YJ81 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HACD1B0YJ81 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HACD1B0YJ81 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HACD1B0YJ81 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HACD1B0YJ81 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HACD1B0YJ81 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HACD1B0YJ81 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HACD1B0YJ81 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HACD1B0YJ81 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HACD1B0YJ81 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HACD1B0YJ81 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HACD1B0YJ81 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
HACD1B0YJ81 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HACD1B0YJ81 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HACD1B0YJ81 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HACD1B0YJ81 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HACD1B0YJ81 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HACD1B0YJ81 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HACD1B0YJ81 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HACD1B0YJ81 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HACD1B0YJ81 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HACD1B0YJ81 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HACD1B0YJ81 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HACD1B0YJ81 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HACD1B0YJ81 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HACD1B0YJ81 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HACD1B0YJ81 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HACD1B0YJ81 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms