Protein–RNA interactions for Protein: A8MUK1

USP17L5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L5A8MUK1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP17L5A8MUK1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP17L5A8MUK1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP17L5A8MUK1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP17L5A8MUK1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP17L5A8MUK1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP17L5A8MUK1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP17L5A8MUK1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP17L5A8MUK1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
USP17L5A8MUK1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP17L5A8MUK1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP17L5A8MUK1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP17L5A8MUK1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP17L5A8MUK1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP17L5A8MUK1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP17L5A8MUK1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP17L5A8MUK1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP17L5A8MUK1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
USP17L5A8MUK1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP17L5A8MUK1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP17L5A8MUK1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
USP17L5A8MUK1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP17L5A8MUK1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP17L5A8MUK1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP17L5A8MUK1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
USP17L5A8MUK1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP17L5A8MUK1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP17L5A8MUK1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP17L5A8MUK1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP17L5A8MUK1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP17L5A8MUK1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP17L5A8MUK1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP17L5A8MUK1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
USP17L5A8MUK1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP17L5A8MUK1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP17L5A8MUK1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP17L5A8MUK1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP17L5A8MUK1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP17L5A8MUK1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP17L5A8MUK1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP17L5A8MUK1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP17L5A8MUK1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP17L5A8MUK1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP17L5A8MUK1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP17L5A8MUK1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP17L5A8MUK1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP17L5A8MUK1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP17L5A8MUK1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP17L5A8MUK1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP17L5A8MUK1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
USP17L5A8MUK1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP17L5A8MUK1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP17L5A8MUK1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP17L5A8MUK1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP17L5A8MUK1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP17L5A8MUK1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP17L5A8MUK1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP17L5A8MUK1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP17L5A8MUK1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP17L5A8MUK1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP17L5A8MUK1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
USP17L5A8MUK1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
USP17L5A8MUK1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP17L5A8MUK1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP17L5A8MUK1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP17L5A8MUK1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP17L5A8MUK1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP17L5A8MUK1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP17L5A8MUK1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP17L5A8MUK1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP17L5A8MUK1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
USP17L5A8MUK1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP17L5A8MUK1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP17L5A8MUK1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP17L5A8MUK1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP17L5A8MUK1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP17L5A8MUK1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP17L5A8MUK1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP17L5A8MUK1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP17L5A8MUK1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP17L5A8MUK1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP17L5A8MUK1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP17L5A8MUK1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP17L5A8MUK1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP17L5A8MUK1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP17L5A8MUK1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP17L5A8MUK1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
USP17L5A8MUK1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP17L5A8MUK1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP17L5A8MUK1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
USP17L5A8MUK1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP17L5A8MUK1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP17L5A8MUK1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
USP17L5A8MUK1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP17L5A8MUK1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP17L5A8MUK1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP17L5A8MUK1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP17L5A8MUK1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP17L5A8MUK1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP17L5A8MUK1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms