Protein–RNA interactions for Protein: A6NGA9

TMEM202, Transmembrane protein 202, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM202A6NGA9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM202A6NGA9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM202A6NGA9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM202A6NGA9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM202A6NGA9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM202A6NGA9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM202A6NGA9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM202A6NGA9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM202A6NGA9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM202A6NGA9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM202A6NGA9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM202A6NGA9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM202A6NGA9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM202A6NGA9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM202A6NGA9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM202A6NGA9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM202A6NGA9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM202A6NGA9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM202A6NGA9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM202A6NGA9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM202A6NGA9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM202A6NGA9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM202A6NGA9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM202A6NGA9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM202A6NGA9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM202A6NGA9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM202A6NGA9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM202A6NGA9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM202A6NGA9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM202A6NGA9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM202A6NGA9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM202A6NGA9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM202A6NGA9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM202A6NGA9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM202A6NGA9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM202A6NGA9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM202A6NGA9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM202A6NGA9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM202A6NGA9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM202A6NGA9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM202A6NGA9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM202A6NGA9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM202A6NGA9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM202A6NGA9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM202A6NGA9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM202A6NGA9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM202A6NGA9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM202A6NGA9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM202A6NGA9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM202A6NGA9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM202A6NGA9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM202A6NGA9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM202A6NGA9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM202A6NGA9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM202A6NGA9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM202A6NGA9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM202A6NGA9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM202A6NGA9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM202A6NGA9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM202A6NGA9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM202A6NGA9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM202A6NGA9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM202A6NGA9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM202A6NGA9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM202A6NGA9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM202A6NGA9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM202A6NGA9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM202A6NGA9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM202A6NGA9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM202A6NGA9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM202A6NGA9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM202A6NGA9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM202A6NGA9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM202A6NGA9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM202A6NGA9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM202A6NGA9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM202A6NGA9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM202A6NGA9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM202A6NGA9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM202A6NGA9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM202A6NGA9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM202A6NGA9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM202A6NGA9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM202A6NGA9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM202A6NGA9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM202A6NGA9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM202A6NGA9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM202A6NGA9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM202A6NGA9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM202A6NGA9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM202A6NGA9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM202A6NGA9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM202A6NGA9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM202A6NGA9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM202A6NGA9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM202A6NGA9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM202A6NGA9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM202A6NGA9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM202A6NGA9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM202A6NGA9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms