Protein–RNA interactions for Protein: A5PL33

KRBA1, Protein KRBA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA1A5PL33 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRBA1A5PL33 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRBA1A5PL33 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRBA1A5PL33 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRBA1A5PL33 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRBA1A5PL33 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRBA1A5PL33 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRBA1A5PL33 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRBA1A5PL33 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRBA1A5PL33 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRBA1A5PL33 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRBA1A5PL33 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KRBA1A5PL33 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRBA1A5PL33 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRBA1A5PL33 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRBA1A5PL33 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRBA1A5PL33 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRBA1A5PL33 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRBA1A5PL33 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRBA1A5PL33 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRBA1A5PL33 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRBA1A5PL33 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRBA1A5PL33 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRBA1A5PL33 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRBA1A5PL33 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRBA1A5PL33 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRBA1A5PL33 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
KRBA1A5PL33 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRBA1A5PL33 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRBA1A5PL33 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRBA1A5PL33 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRBA1A5PL33 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRBA1A5PL33 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRBA1A5PL33 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRBA1A5PL33 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRBA1A5PL33 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRBA1A5PL33 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRBA1A5PL33 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRBA1A5PL33 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRBA1A5PL33 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRBA1A5PL33 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRBA1A5PL33 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRBA1A5PL33 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRBA1A5PL33 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRBA1A5PL33 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRBA1A5PL33 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRBA1A5PL33 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRBA1A5PL33 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRBA1A5PL33 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KRBA1A5PL33 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRBA1A5PL33 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRBA1A5PL33 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KRBA1A5PL33 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRBA1A5PL33 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRBA1A5PL33 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRBA1A5PL33 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRBA1A5PL33 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRBA1A5PL33 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRBA1A5PL33 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRBA1A5PL33 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRBA1A5PL33 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRBA1A5PL33 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRBA1A5PL33 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRBA1A5PL33 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRBA1A5PL33 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRBA1A5PL33 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRBA1A5PL33 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRBA1A5PL33 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRBA1A5PL33 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KRBA1A5PL33 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KRBA1A5PL33 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRBA1A5PL33 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRBA1A5PL33 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRBA1A5PL33 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRBA1A5PL33 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRBA1A5PL33 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRBA1A5PL33 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRBA1A5PL33 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRBA1A5PL33 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRBA1A5PL33 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KRBA1A5PL33 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRBA1A5PL33 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRBA1A5PL33 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRBA1A5PL33 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KRBA1A5PL33 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRBA1A5PL33 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRBA1A5PL33 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRBA1A5PL33 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRBA1A5PL33 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KRBA1A5PL33 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRBA1A5PL33 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRBA1A5PL33 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRBA1A5PL33 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRBA1A5PL33 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRBA1A5PL33 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRBA1A5PL33 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRBA1A5PL33 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRBA1A5PL33 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRBA1A5PL33 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRBA1A5PL33 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms